Op verschillende plaatsen splitst de spoorlijn zich af waardoor andere treinroutes ontstaan. Zo begint de BAM Express als afsplitsing van de Trans Siberische Spoorlijn in het kleine plaatsje Tajshet, waarna het spoor boven het Baikalmeer langs gaat.

Onder het Baikalmeer bij Oelan Oede buigt het spoor af naar het zuiden richting Mongolië, de beroemde Trans Mongolië Express. Nog een afsplitsing vindt plaats net voorbij de Russische stad Chita, waarbij het spoor een stuk Russisch Verre Oosten meeneemt en door de Chinese provincie Mantsjoerije rijdt, de zogenaamde Trans Mantsjoerije Express.